禽流感需要与普通感冒、流感、支原体肺炎、细菌性肺炎、传染性单核细胞增多症等疾病进行鉴别。这些疾病在症状表现上可能与禽流感相似，但病因、传播途径及治疗方案存在差异。
普通感冒通常由鼻病毒等引起，症状以鼻塞、流涕、打喷嚏为主，发热多为低热且持续时间短。禽流感则表现为持续高热、肌肉酸痛及全身乏力，部分患者可能出现呼吸困难。普通感冒无须特殊治疗，而禽流感需尽早使用奥司他韦胶囊等抗病毒药物。
流感和禽流感均由流感病毒引起，但病毒亚型不同。两者均可出现高热、咳嗽、头痛等症状，但禽流感更易进展为重症肺炎。流感可通过接种疫苗预防，治疗可使用磷酸奥司他韦颗粒，而禽流感需严格隔离并加强抗病毒治疗。
支原体肺炎多见于儿童及青少年，起病缓慢，以刺激性干咳为主要表现，胸部X线可见斑片状阴影。禽流感起病急骤，咳嗽常伴痰中带血。支原体肺炎首选阿奇霉素片治疗，禽流感则需使用帕拉米韦氯化钠注射液等神经氨酸酶抑制剂。
细菌性肺炎常见病原体为肺炎链球菌，患者多有寒战、铁锈色痰等症状，血常规显示白细胞明显升高。禽流感早期白细胞可能正常或降低。细菌性肺炎需使用注射用头孢曲松钠等抗生素，禽流感则需针对性抗病毒治疗。
该病由EB病毒感染引起，典型表现为发热、咽峡炎、淋巴结肿大，外周血可见异型淋巴细胞。禽流感无特征性淋巴结肿大，但可能出现消化道症状。传染性单核细胞增多症多为自限性，而禽流感需密切监测病情变化。
出现发热伴呼吸道症状时，应详细询问禽类接触史及流行病学史。禽流感患者需隔离治疗并上报疫情，接触者应医学观察。日常注意个人防护，接触活禽后彻底洗手，禽肉蛋类充分煮熟。出现持续高热、呼吸困难等症状须立即就医，避免自行用药延误病情。
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